HYDE
HYDE ist eine neue Methode zur energetischen Bewertung von Protein-Ligand-Komplexen. Die Hyde-Funktion wurde anhand von gemessenen Oktanol-Wasser-Verteilungskoeffizienten (logP-Werte) parametrisiert und bewertet in konsistener Weise Wasserstoffbrücken, Dehydratation und den hydrophoben Effekt. Die patentierte Hyde-Technologie wurde gemeinsam mit Bayer CropScience und der BioSolveIT GmbH entwickelt. Hyde ist Teil der LeadIT-Software (BioSolveIT GmbH).
HYDEPublikationen
- Schneider, N., Klein, R., Lange, G., Rarey, M. (2012) Nearly no Scoring Function without a Hansch-Analysis . Molecular Informatics, 31(6-7):503–507.
- Schneider, N., Hindle, S., Lange, G., Klein, R., Albrecht, J., Briem, H., Beyer, K., Claußen, H., Gastreich, M., Lemmen, C., Rarey, M. (2011) Substantial improvements in large-scale redocking and screening using the novel HYDE scoring function . Journal of Computer-Aided Molecular Design, 26(6):701-723.
- Reulecke, I., Lange, G., Albrecht, J., Klein, R., Rarey, M. (2008) Towards an integrated description of hydrogen bonding and dehydration: II. Reducing false positives in virtual screening using the HYDE scoring function . ChemMedChem, 3(6):885-897.